• Основные образовательные и научные подразделения

  • Мегафакультет компьютерных технологий и управления
    • Факультет систем управления и робототехники
    • Факультет программной инженерии и компьютерной техники
    • Факультет безопасности информационных технологий
      • Межотраслевой научно-образовательный центр "Безопасность и надежность критических цифровых технологий"
        • Учебно-практический центр - Киберполигон
    • Лаборатория молодежной робототехники
    • Институт перспективных систем передачи данных
      • Научно-исследовательский центр перспективных функциональных материалов и лазерных коммуникационных систем
      • Научно-исследовательский центр радиофотонных систем передачи данных

  • Физико-технический мегафакультет
    • Физический факультет
    • Научно-образовательный центр фотоники и оптоинформатики
    • Международный научно-образовательный центр физики наноструктур

  • Мегафакультет трансляционных информационных технологий
    • Институт искусственного интеллекта
    • Факультет информационных технологий и программирования
    • Факультет прикладной информатики
    • Факультет технологий искусственного интеллекта
    • Институт прикладных компьютерных наук
    • Институт дизайна и урбанистики
    • Школа разработки видеоигр
    • Высшая школа цифровой культуры

  • Мегафакультет наук о жизни
    • Факультет химбиоинженерии
    • Факультет инфонаук о жизни
      • Центр искусственного интеллекта в агробиотехнологиях
      • Образовательно-научный центр наук о жизни
      • Научно-образовательный центр инфохимии
    • Факультет биотехнологий
    • Факультет экотехнологий
      • Центр дополнительного образования для школьников "Гринтех"

  • Факультет технологического менеджмента и инноваций

  • Военный учебный центр

  • Образовательный центр "Энергоэффективные инженерные системы"

  • Инновационный индустриальный центр ПАО "Газпром нефть" - Университет ИТМО
    • Научно-образовательный центр "Газпром нефть-ИТМО"

  • Центр социальных и гуманитарных наук

  • Передовая инженерная школа ИТМО интердисциплинарного инжиниринга

• Административные (сервисные) подразделения

  • Стратегические коммуникации
    • Департамент по стратегическим коммуникациям
      • Образовательный центр Альфа-Банка

  • Сопровождение международной деятельности
    • Институт международного развития и партнерства
      • Лаборатория онлайн-педагогики